SARS-OMICs
Atlas multi-ômico da COVID-19 brasileira
Sobre o projeto
COVID-19 é uma síndrome respiratória que foi declarada pandemia global em março de 2020. A pior pandemia dos últimos 100 anos! O agente etiológico desta infecção foi identificado como um novo coronavírus, denominado SARS-CoV-2. Os sintomas variam desde quadros gripais leves à necessidade de ventilação mecânica por longo período, internações em UTI e óbito. Até o momento não se conhece a fundo os fatores que determinam as diferentes gravidades da doença, mas acredita-se que seja uma mistura de fatores genéticos do vírus e intrínsecos do hospedeiro.
Através do sequenciamento de nova geração (NGS), este projeto irá caracterizar de forma ampla e compreensiva os microrganismos do trato respiratório de pacientes com COVID19. Para tal, serão utilizadas abordagens ômicas, que incluem Viroma, Microbioma 16S/ITS, Metagenômica Shotgun e sequenciamento direcionado do SARS-CoV-2.
Por estas abordagens, esperamos entender como co-infecções virais, a composição do microbioma respiratório e fatores genéticos do vírus podem influenciar nos desfechos clínicos da doença. Serão incluídas no estudo cerca de 600 amostras de indivíduos acompanhados pelo projeto Registro brasileiro prospectivo de avaliação clínica de Indivíduos Infectados com SARS-CoV-2, realizado pelo PROADI-SUS em parceria com o Hospital Israelita Albert Einstein.
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Conheça um pouco mais das nossas publicações!
Quem são as pessoas envolvidas
Quem são as pessoas que estão trabalhando no projeto.
João Renato Rebello Pinho
Coordenador Médico - Laboratório Clínico do Hospital Israelita Albert Einstein
Pesquisador principal e responsável pelo projeto
Murilo Castro Cervato
CEO Varstation e Gerente de Ciência de Dados e Bioinformática no Hospital Israelita Albert Einstein
Responsável pela gestão e integração da equipe multidisciplinar do projeto
Tatiana Ferreira de Almeida
Médica Geneticista do Laboratório Clínico do Hospital Albert Einstein
Responsável pela coalizão de projetos com COVID19 e pelo Biobanco de amostras
Deyvid Amgarten
Bioinformata no Hospital Israelita Albert Einstein
Responsável pelo desenvolvimento das análises de bioinformática relacionadas com genômica viral e metagenômica.
Fernanda de Mello Malta
Analista de laboratório Sr. no Hospital Israelita Albert Einstein
Responsável pela equipe laboratorial, atuando no sequenciamento de nova geração (NGS).
Raquel Riyuzo
Bioinformata no Hospital Israelita Albert Einstein
Responsável pelo desenvolvimento das análises de bioinformática relacionadas com microbioma e metagenômica.
Ana Paula Moreira Salles
Analista de laboratório Jr no Hospital Israelita Albert Einstein
Responsável pelo sequenciamento de nova geração (NGS).
Pedro Henrique Sebe Rodrigues
Cientista de Dados no Hospital Israelita Albert Einstein
Responsável pela análise estatística e mineração de dados.
Leandro Navatta Ribeiro
Desenvolvedor
Responsável pela gestão de infraestrutura e sistemas do projeto.
Ana Laura Boechat Borges
PhD Bioquímica
Responsável pelo sequenciamento de nova geração (NGS).
Maiara Prado Garcia Antonio
B.Sc Ciências Biomédicas
Responsável pelo sequenciamento de nova geração (NGS).
Tania Girão Mangolini
Analista de Sistemas
Responsável pela estruturação de banco de dados.
Ketti Gleyzer De Oliveira
Monitora de Pesquisa Clínica no Hospital Albert Einstein
Responsável pelo desenvolvimento e acompanhamento de processos relacionados à pesquisa clínica
Ricardo Andreotti Siqueira
Monitor de Pesquisa Clínica no Hospital Albert Einstein
Responsável pelo desenvolvimento e acompanhamento de processos relacionados à pesquisa clínica
Gabriela Borges Cherulli Colichio
Monitora de Pesquisa Clínica no Hospital Albert Einstein
Responsável pelo desenvolvimento e acompanhamento de processos relacionados à pesquisa clínica
Beatriz Miranda
Graduanda em Informática Biomédica
Responsável pela análise estatística e mineração de dados.
Rafael da Silva Barbosa
Cursando Ensino Técnico de Marketing
Responsável pela divulgação e mídias sociais.
Organizações parceiras
